Аркнайтс: Прелюдия к рассвету

События происходят в мире Терра, который имеет сходства с Землей, но отличается наличием живых существ с чертами животных и способностью использовать магию, известную как Искусство Оригиниума. Мир подвергается регулярным Катастрофам, вынуждающим население к постоянным перемещениям для выживания. Эти катастрофы привели к возникновению заболевания Орипатия, характеризующегося высокой заразностью и стопроцентной летальностью. Инфицированные изолируются от общества для предотвращения распространения болезни.

Главный персонаж, известный под кличкой Доктор, страдает амнезией и не помнит своего прошлого. Он возглавляет фармакологическую и медицинскую компанию «Остров Родос», которая занимается лечением зараженных Орипатией. Организация также противостоит группе инфицированных, стремящихся отомстить правительству за преследование больных. Конфликт развивается вокруг борьбы за права зараженных и поиска способов противодействия заболеванию.